Los puntos más representativos de la diversidad biológica del Ecuador están identificados en 48 espacios dentro del Sistema Nacional de Áreas Protegidas, 3 de ellos aún no identificados en el sitio web del Ministerio del Ambiente (MAE); sin embargo, de los 36 conformados antes del 2007, 14 no cuentan con un plan de manejo, 17 están desactualizados y solo 5 en vigencia, según un informe de la misma institución. Las 12 nuevas áreas, creadas durante este Gobierno, tampoco han completado este documento, pese a que la ley ordena que esté listo 180 días después de la fundación oficial.