Otto Morcillo fue formado como entrenador por Dusan Draskovic en la época en que este estuvo al frente de la Tricolor (1988-1993) y, junto con Carlos Torres Garcés, se convirtió en uno de los técnicos nacionales más prometedores y de mayor proyección. Fue asistente de Draskovic en varios torneos internacionales, dirigió selecciones menores y estuvo en clubes como Emelec, Green Cross y Manta FC. Pero la dirigencia del país lo fue relegando.