Fue el jefe de la campaña presidencial de PAIS y, desde el inicio del gobierno, como Secretario de la Administración, trabaja como una especie de puente entre los ministros y Rafael Correa, al estar al tanto de lo que ocurre en cada uno de los ministerios y entidades del Ejecutivo. Vinicio Alvarado es uno de los funcionarios de mayor confianza e importancia para el Mandatario.