El golero fue protagonista de la primera participación de Ecuador en la Copa del Mundo en Japón-Corea del Sur 2002.

En la memoria de José Francisco Cevallos quedarán grabadas dos fechas: el 7 de noviembre del 2001 y el 3 de junio del 2002. En la primera fue uno de los protagonistas principales de la histórica primera clasificación de Ecuador a un Mundial de fútbol, luego del empate a 1 con Uruguay, en Quito.