La Universidad Católica de Santiago de Guayaquil inició su historia el 17 de mayo de 1962 cuando el Gobierno Nacional aprobó el funcionamiento de la institución.
Sus fundadores fueron el arzobispo de Guayaquil, monseñor Antonio Mosquera Corral, el padre Joaquín Flor y el jurista Leonidas Ortega.
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Empezó con las facultades de Jurisprudencia, Ciencias Sociales y Políticas; Filosofía y Ciencias Matemáticas que se dictaron en las instalaciones del colegio nocturno 20 de Abril hasta el año 1965.