Solo se designaba a un vicepresidente; este –al igual que el presidente– pertenecía a cualquier partido político.

De 1991 al 1998 se eligieron 4 presidentes del Parlamento: Fabián Alarcón (ex FRA, ahora Alfarismo Nacional), de 1991 a 1992; de 1995 a 1996; y de 1996 a 1997; Carlos Vallejo (ex DP, ahora Prian), de 1992 a 1993; el liberal Samuel Belletini, de 1993 a 1994; Heinz Moeller (ex PSC), de 1994 a 1995; y de 1997 a 1998.

Desde 1998, el Legislativo tuvo 4 presidentes, a pesar de que la elección de un presidente y 2 vicepresidentes se realiza cada 2 años.

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Según el artículo 129 de la Carta Magna, para los primeros 2 años se elige al presidente del partido que tenga la mayor representación legislativa; el primer vicepresidente del que tenga la segunda mayoría y el segundo vicepresidente, de los partidos o movimientos minoritarios.

Para los siguientes dos años, el presidente y el primer vicepresidente se elegirán de entre los partidos que hayan obtenido la segunda y la primera mayoría.

En la elección de 1998, el partido más votado fue la DP. La presidencia la asumió Juan José Pons (ahora UNO).

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En el período siguiente, la disposición no se cumplió pues el PSC candidatizó a Xavier Neira; cuyo nombre fue rechazado por los bloques.

El 1 de agosto del 2000 –durante una sesión accidentada de la que se retiraron los socialcristianos– una mayoría formada por el PRE, la DP y la centroizquierda eligió a Susana González.

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La designación fue apelada por el PSC ante el Tribunal Constitucional, el cual se pronunció a su favor y ella dejó el cargo a los 21 días.

El 30 de agosto, la misma mayoría eligió a Hugo Quevedo (ex PSC), quien no terminó su período porque fue acusado de piponazgo.

José Cordero (DP) fue electo el 6 de junio del 2001.