En Ecuador el secuenciamiento genómico del virus se realiza desde marzo del 2020. Desde allí ya son más de 3.300 muestras las que han sido analizadas y subidas a plataformas internacionales como Gisaid.

A través de un comunicado, el Ministerio de Salud dio a conocer que el Instituto Nacional de Investigación y Salud Pública (INSPI), uno de los tres laboratorios principales que realizan este proceso (los otros dos son la Universidad de Especialidades Espíritu Santo y Universidad San Francisco de Quito), ha secuenciado 3.163 muestras positivas de COVID-19 hasta diciembre del 2021.

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De ese análisis el 55,26%, es decir, 1.748 corresponden a cuatro de cinco variantes de preocupación. Estas son delta, gama, alfa y ómicron.

La Organización Mundial de Salud clasifica a las variantes del SARS-CoV-2 en de preocupación y de interés. El primer grupo, compuesto por cinco variantes, corresponde variantes que tengan alguna de estas tres características: aumento de transmisibilidad, de virulencia o disminución de eficacia de vacunas y tratamientos.

En las variantes de interés, integrada por mu y lambda, deben tener características que indiquen que pueden entrañar un nuevo riesgo para la salud pública mundial.

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En los últimos meses la variante delta se ha vuelto predominante en el país, el INSPI ha detectado 1.134 con esta variante; le siguen gama con 345 y alfa con 266. En el caso de ómicron ya se han reportado tres casos. En el caso de la variante mu se han contabilizado 541. El resto corresponde a variantes no clasificadas de menor contagiosidad (873).

En agosto pasado la entidad había indicado que se secuenciaron 917 genomas teniendo como predominante la variante iota que la OMS la pasó de variante de interés a bajo vigilancia.

Estas son las provincias que más variantes de preocupación se han encontrado, de acuerdo al INSPI:

Delta (B.1.617.2)

• Guayas: 200 secuencias
• Manabí: 197 secuencias
• El Oro: 168 secuencias
• Pichincha: 149 secuencias
• Santo Domingo de los Tsáchilas: 78 secuencias

Alfa (B.1.1.7)

• Pichincha: 100 secuencias
• Chimborazo: 39 secuencias
• Guayas: 18 secuencias
• Santo Domingo de los Tsáchilas: 16 secuencias
• Los Ríos: 14 secuencias

Gama (P.1)

• Pichincha: 89 secuencias
• Guayas: 68 secuencias
• El Oro: 22 secuencias
• Manabí: 20 secuencias
• Chimborazo: 20 secuencias

Ómicron (B.1.1.529)

• Pichincha: 2 secuencias
• Guayas: 1 secuencia

El INSPI realiza este proceso desde junio del 2020, pero se incrementó la capacidad en julio de este año. La entidad dio a conocer que el proceso de secuenciamiento se realiza en su sede central en Guayaquil.