Guayaquil City y Fernando Gaibor acabaron con los rumores que en su momento lo situaban en Barcelona SC, Liga de Quito o Emelec. El mediocampista de 29 años firmó por tres temporadas con el cuadro ciudadano. Gaibor fue una de las apuestas importantes del City para la segunda etapa de LigaPro 2020, dentro de los siete encuentros que disputó aportó con un gol y dos asistencias, según el servicio de estadísticas de LigaPro.