La Universidad Cooperativa de Colombia (UCCE) fue intervenida por el Conesup en diciembre del 2001 hasta mayo del 2004. Durante este periodo se clausuraron 22 sedes de esa entidad que se establecieron en varias provincias de forma ilegal. De los más de dos mil expedientes revisados, 142 fueron falsos, aseguró Vinicio Baquero, director ejecutivo del Conesup.

La UCCE, que aún está en funcionamiento, fue creada por resolución del Congreso el 10 de agosto de 1998, pese a no tener un informe favorable del Consejo Nacional de Universidades y Escuelas Politécnicas (Conuep ahora Conesup), un día antes de que entrara en vigencia la nueva ley que creó el Conesup y que determinó que una entidad académica no puede abrirse sin una recomendación de este.