Cualquier iraquí o quien haya vivido en Iraq entre el 17 de julio de 1968, fecha del golpe de Estado de Hussein, y el 1 de mayo del 2003, cuando EE.UU. culminó las operaciones mayores en Iraq, puede ser juzgado por la corte.

Aunque están bajo custodia legal del tribunal, la seguridad de los acusados se dio a tropas extranjeras hasta cuando las fuerzas de seguridad iraquíes estén debidamente entrenadas.

El Tribunal Especial incluye un tribunal de primera instancia compuesto por 5  jueces permanentes nombrados por cinco años, una corte de apelación  de nueve magistrados, 20 jueces de instrucción por tres años y 20 fiscales con contrato de tres años.

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Para el veredicto será necesaria la mayoría simple. El acusado está en el derecho de permanecer en silencio y de tener abogados extranjeros siempre que haya un iraquí que los dirija.