Este se extendió también a los organismos de control, cuyos titulares designa el Congreso.
Así, la presidencia del Tribunal Supremo Electoral fue para el PSC y la del Tribunal Constitucional para la DP.

El PSC propuso a Mariana Yépez a la Fiscalía, Milton Álava a la Defensoría del Pueblo, Alfredo Corral a la Contraloría y Ramón Jiménez a la Procuraduría. La DP a los titulares de tres superintendencias: Jorge Egas Peña en la de Bancos, Javier Muñoz en la de Compañías y Hugo Ruiz en la de Telecomunicaciones.