El ex jefe del Comando Conjunto de las Fuerzas Armadas y ex comandante de la Fuerza Aérea Ecuatoriana, general Frank Vargas Pazzos, (1984-1986), negó que hayan existido centros de tortura para opositores políticos en el gobierno de León Febres-Cordero (1984-1988), como  aseguró Rosa Mireya Cárdenas, integrante de la Comisión de la Verdad.

“Mientras  estuve en el mando  jamás conocí de  algún centro de torturas en las Fuerzas Armadas. Yo no puedo opinar de otros organismos porque  no conozco. Yo como comandante que dirigí a la fuerza en sus operativos logísticos,  en su empleo, mejoramiento e instrucción,   jamás he conocido un lugar de ese tipo desde que fui cadete hasta general”.

Vargas Pazzos mientras se desempeñaba como jefe del Comando Conjunto se sublevó y secuestró al presidente Febres-Cordero en la base militar de Taura, entre el 7 y  11 de marzo de 1986. Fue juzgado por sublevación e intento  de desestabilización al régimen. 

Por este levantamiento, Febres-Cordero  reemplazó al ministro de Defensa de ese entonces,  general Luis Piñeiros, y el comandante  del Ejército, general Manuel María Albuja.

Sin embargo,  el coronel en servicio pasivo Patricio Haro reconoció que durante esos años  la fuerza pública enfrentó al  grupo insurgente  Alfaro Vive Carajo y dijo que varios militantes del grupo irregular fueron detenidos en el  Batallón de Inteligencia Militar del Ejército.

“Esta es una unidad especializada de concentración para buscar información a toda  clase de enemigos del Estado. Yo no creo que ese campamento  que está   en Conocoto (ahora es la Escuela Nacional de Inteligencia)  haya sido un centro de torturas.  Obviamente,  habrá tenido sus celdas y lugares de detención donde les  hayan hecho interrogatorios, declaraciones, es cierto”.

Haro dudó de la certeza de los testimonios de torturas.