Según la Contraloría, el distributivo de sueldos del personal de la Asamblea Constituyente fue modificado sin que existan las resoluciones de la Comisión Directiva, tal como lo prevé el numeral 2 del artículo 6 del Reglamento de Funcionamiento de ese organismo.

Un ejemplo de la modificación en los distributivos de sueldos está la creación del cargo de “Nutricionista”, que es justificada por el director administrativo de la Constituyente, Francisco Torres, como una "revisión de la clasificación" del cargo que antes le correspondía a Trabajo Social, lo cual  no requiere de la emisión de resolución alguna por parte de la Asamblea.

De 726 puestos previstos en el distributivo a marzo del 2008, se suprimieron cinco de auxiliares de servicio y se crearon, en su lugar, un técnico de lengua en señas para la Unidad de Comunicación Social e Imagen Corporativa, un periodista en la Unidad de Comunicación y un terapeuta, en la Unidad de Recursos Humanos.

Además, se reclasificó el puesto de Secretaria del Departamento Financiero como Asistente Administrativo 2.

La Contraloría determina que si bien no se modificó el monto del presupuesto de remuneraciones, sí se suprimieron y crearon cargos sin autorización de la Comisión.

Entre el 29 de noviembre del 2007 y el 11 de julio, la Asamblea gastó $ 14 millones en el pago de sueldos.