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En el año 2005 la Federación Ecuatoriana de Fútbol decidió en un congreso ordinario darle más dinamismo a la Copa Pilsener para lo cual dividió el campeonato en dos, adoptando así el formato utilizado en otros países como Argentina, donde en el mismo año se juega el campeonato Apertura y campeonato Clausura. Este año el formato del torneo volvió a ser como el anterior con una liguilla final de la cual sale un único campeón.
(a) Torneo Apertura
(c) Torneo Clausura | 
