Una modificación a los diseños del proyecto vial, propuesto en el convenio firmado entre Ecuador y Perú, pone en riesgo la cooperación no reembolsable de la Comisión Europea (CE), y además se podría considerar como un incumplimiento por parte del Ecuador, según Robert Castro, funcionario del Plan Binacional.

Los delegados de la CE convocaron a una reunión urgente a los miembros del Plan para conocer qué sucede con la consulta popular.

Los recursos de la CE,  51 millones de euros (64,77 millones de dólares), se perderían porque el convenio no prevé una modificación de la obra, y hay una cláusula que estipula que si la totalidad de los fondos no se han contractualizado hasta tres años después de la firma del convenio (24 de noviembre del 2005) estos serán devueltos a la CE.

Los estudios realizados entre el 2003 y el 2005 fueron acompañados por los ministerios de ambos países.